- 1. Úvod
- 2. Analýza dat
- 2.1. Obecný průběh analýzy
- 2.2. Analýza vysokopokryvných genomických dat
- 2.2.1. DNA mikročipy
- 2.2.1.1. Základní princip DNA mikročipů
- 2.2.1.2. Výroba mikročipu
- 2.2.1.3. Typy mikročipů
- 2.2.1.4. Návrh mikročipových experimentů
- 2.2.1.5. Předzpracování dat
- 2.2.1.6. Normalizace
- 2.2.1.7. Analýza expresních čipů
- 2.2.1.8. Analýza CGH čipů
- 2.2.1.8.1. Metody založené na segmentaci resp. na odhalení bodu zlomu
- 2.2.1.8.2. Metody založené na shlukování
- 2.2.1.8.3. Metody založené na skrytých Markovových modelech
- 2.2.1.8.4. Metody založené na segmentaci
- 2.2.1.8.5. Metody hledající specifické skupiny opakujících se aberací
- 2.2.1.8.6. Reference
- 2.2.1.9. Příklad
- 2.2.1.10. Meta-analýza mikročipových experimetnů
- 2.2.1.11. Analýza biologických drah
- 2.2.2. Analýza DNA sekvencí
- 2.2.1. DNA mikročipy
- 2.3. Analýza vysokohustotních proteomických dat
- 3. Software
E-learning 2. Analýza dat 2.2. Analýza vysokopokryvných genomických dat 2.2.1. DNA mikročipy 2.2.1.11. Analýza biologických drah
Autor kapitoly 2.2.1.11:
Claus-Dieter Mayer
Biomathematics and Statistics Scotland (BioSS)
Rowett Institute of Nutrition and Health
Aberdeen University
Metody pro Analýzu biologických drah a genových sad z mikročipových dat nalezntete v této prezentaci (autor Claus-Dieter Mayer).