Softwarová prostředí pro výpočetní neuroanatomii

Z Zobrazování morfologie mozku v psychiatrii

Přejít na: navigace, hledání

Zde uvádíme odkazy na softwarová prostředí, pomocí kterých je možné provádět analýzy pomocí přístupů výpočetní neuroanatomie. Všechny jsou volně k dispozici na uvedených webových stránkách.

SPM – VBM implementace Johna Ashburnera, velmi dobrá dokumentace a podpora formou e-mailového fóra. Nevýhodou potřeba programu MATLAB, který je komerční. http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/

FSL – obdobně komplexní prostředí, nevyžaduje MATLAB. http://www.fmrib.ox.ac.uk/fsl/

HAMMER – implementace C. Davatzikose, vychází z analýzy RAVENS map, které obsahují informace o objemu tkáně v jednotlivých voxelech. Spolupracuje s klasifikačním programem COMPARE. https://www.rad.upenn.edu/sbia/software/index.html

MINC tools – komplexní prostředí pro výpočetní neuroanatomii i volumetrii, nevyžaduje MATLAB. http://www.bic.mni.mcgill.ca/software/

Další (Brains2 http://www.psychiatry.uiowa.edu/mhcrc/IPLpages/BRAINS.htm, LONI http://www.loni.ucla.edu/, CAMBA http://www-bmu.psychiatry.cam.ac.uk/software/...)

Osobní nástroje